Tajikistan là nơi có những ngọn núi cao nhất thế giới, bao gồm dãy Pamir và Alay. 93% Tajikistan là núi với độ cao từ 300 m (980 ft) đến gần 7.500 m (24.600 ft), và gần 50% lãnh thổ Tajikistan đang ở trên 3.000 m (9.800 ft).

Các dãy núi lớn được cắt bởi hàng trăm hẻm núi và các hẻm núi ở cuối dòng chảy chảy vào các thung lũng sông lớn, nơi mà phần lớn các dân số nước này đang sống và làm việc. Dãy Pamir đặc biệt có rất nhiều sông băng, và Tajikistan là nơi có sông không ở vùng cực lớn nhất thế giới, sông băng Fedchenko.

Dãy núi Pamir ở Tajikistan nằm ở tỉnh Gorno-Badakhshan (GBAO) ở nửa phía đông của đất nước. Biên giới phía bắc được tạo thành bởi dãy Trans-Alay (đỉnh Độc lập 7.174 m (23.537 ft), đèo Kyzylart 4.280 m (14.040 ft)). Đỉnh cao nhất là đỉnh Ismail Samani (7.495 m (24.590 ft), ở cạnh phía tây bắc của GBAO. Nó nằm giữa đỉnh Ibn Sina (7.134 m (23.406 ft) nằm trên đường biên giới với Kyrgyzstan ở phía bắc và Peak Korzhenevskaya (7.105 m (23.310 ft)) trong dãy Viện hàn lâm Khoa học (6.785 m (22.260 ft)) về phía nam. Biên giới phía nam được tạo thành bởi những rặng núi phía bắc của dãy Karakoram với đỉnh Mayakovskiy (6.096 m (20.000 ft), đỉnh Karl Marx (6.726 m (22.067 ft), đỉnh Engels (6.510 m (21.360 ft) và Đỉnh Concord (5.469 m (17.943 ft) trải dài từ tây sang đông dọc theo biên giới với Afghanistan.